Lembaga Pengampunan mempunyai kuasa untuk memberi nasihat kepada Yang di-Pertuan Agong. Melihat kepada kedudukan undang-undang sekarang, Lembaga Pengampunan mempunyai tiga jenis kuasa, memberi keampunan, menunda hukuman dan melegakan hukuman, menurut Pensyarah Kuliyyah Undang-Udang Ahmad Ibrahim, Universiti Islam Antarabangsa Malaysia (UIAM), Prof Datuk Shamrahayu Ab Aziz.